銨離子選擇電極法在線分析儀采用矩陣式的系統(tǒng)校正，即將銨離子選擇電極、鉀離子選擇電極、pH電極和溫度電極的值看做一個系統(tǒng)，實際得出的NH₄⁺-N濃度是根據(jù)這個系統(tǒng)中四個電極測量的數(shù)值作為一個系統(tǒng)互相補償計算得出的。矩陣校準(zhǔn)就是調(diào)整這個系統(tǒng)中四個電極測量值的相互補償關(guān)系來計算出準(zhǔn)確的NH₄⁺-N濃度。
       銨離子選擇電極法在線分析儀在出廠時已經(jīng)做了矩陣校準(zhǔn)，但是在實際水樣中，尤其是 污水處理廠的水樣當(dāng)中，一般還需要進(jìn)行手動的一點或兩點校準(zhǔn)。
       混合的水對離子選擇膜有很大的影響，膜需要在混合水中適應(yīng)數(shù)小時才能趨于穩(wěn)定。為 了補償混合水對膜的影響，要根據(jù)實驗室數(shù)據(jù)做一次現(xiàn)場校準(zhǔn)，即在校正菜單里，輸人當(dāng)時 的樣品的實驗室數(shù)據(jù)。一旦發(fā)現(xiàn)探頭顯示的數(shù)據(jù)和實驗室的分析數(shù)據(jù)有較大的差別時，應(yīng)該 重新輸入校準(zhǔn)數(shù)位。
       一般推薦在探頭（pH探頭）入水工作1h后進(jìn)行一次一點的現(xiàn)場手工校準(zhǔn),入水工作12h后再進(jìn)行 一次校準(zhǔn)。然后保證每周做一次校準(zhǔn)，基本可以保證測量值與實驗室數(shù)據(jù)較為吻合。如果一點校準(zhǔn)不能滿足全量程的測量，或者測量范圍的變化超過10倍，則推薦使用兩點校準(zhǔn)。
       由于測量原理的原因，不能使用氨氮標(biāo)準(zhǔn)溶液對銨離子選擇電極進(jìn)行校正，因為該分析 儀測量的是按離子，而并非氨氮。